백준알고리즘 - 1969번 DNA - 파이썬(Python)

문제

DNA란 어떤 유전물질을 구성하는 분자이다. 이 DNA는 서로 다른 4가지의 뉴클레오티드로 이루어져 있다(Adenine, Thymine, Guanine, Cytosine). 우리는 어떤 DNA의 물질을 표현할 때, 이 DNA를 이루는 뉴클레오티드의 첫글자를 따서 표현한다. 만약에 Thymine-Adenine-Adenine-Cytosine-Thymine-Guanine-Cytosine-Cytosine-Guanine-Adenine-Thymine로 이루어진 DNA가 있다고 하면, “TAACTGCCGAT”로 표현할 수 있다. 그리고 Hamming Distance란 길이가 같은 두 DNA가 있을 때, 각 위치의 뉴클오티드 문자가 다른 것의 개수이다. 만약에 “AGCAT"와 ”GGAAT"는 첫 번째 글자와 세 번째 글자가 다르므로 Hamming Distance는 2이다.

우리가 할 일은 다음과 같다. n개의 길이가 같은 DNA가 주어져 있을 때(이 DNA를 a1a2a3a4...이라고 하자) Hamming Distance의 합이 가장 작은 DNA s를 구하는 것이다. 즉, s와 a1의 Hamming Distance + s와 a2의 Hamming Distance + s와 a3의 Hamming Distance ... 의 합이 최소가 된다는 의미이다.

 

입력

첫 줄에 DNA의 수 N과 문자열의 길이 M이 주어진다. 그리고 둘째 줄부터 N+1번째 줄까지 N개의 DNA가 주어진다. N은 1,000보다 작거나 같은 자연수이고, M은 50보다 작거나 같은 자연수이다.

 

출력

첫째 줄에 Hamming Distance의 합이 가장 작은 DNA 를 출력하고, 둘째 줄에는 그 Hamming Distance의 합을 출력하시오. 그러한 DNA가 여러 개 있을 때에는 사전순으로 가장 앞서는 것을 출력한다.

 

예제 입력과 출력

 

 

 

 

알고리즘 분류

그리디 알고리즘

 

정답

 

n,m=map(int,input().split())
a=[]
c=[]
h=0

for i in range(n):
    a.append(input())

for i in range(m):
    b=[0]*4
    d=[]
    for j in range(n):
        if a[j][i] == 'A':
            b[0] += 1
        elif a[j][i] == 'C':
            b[1] += 1
        elif a[j][i] == 'G':
            b[2] += 1
        else:
            b[3] += 1
            
        d.append(a[j][i])
        
    if b[0] == max(b):
        t='A'
    elif b[1] == max(b):
        t='C'
    elif b[2] == max(b):
        t='G'
    else:
        t='T'
    c.append(t)
    h=h+len(d)-d.count(t)

print(''.join(c))
print(h)

 

---

백준 알고리즘 1969번 : https://www.acmicpc.net/problem/1969

1969번: DNA